Ubuntu ponúka komplexný systém pre správu balíkov, t.j. pre inštaláciu, aktualizáciu, konfiguráciu a odobratie softvéru. Okrem toho, že nám Ubuntu poskytne prístup k vyše 24 000 zotriedených softvérových balíkov pre náš počítač, systém pre správu balíkov vyrieši aj vzájomné závislosti balíkov a kontrolu aktualizácií softvéru.
Existujú viaceré nástroje, ktoré spolupracujú so správcom balíkov Ubuntu od jednoduchých príkazov príkazového riadka, ktoré môžu byť jednoducho zautomatizované správcom systému, až po jednoduché grafické rozhranie, ktoré je ľahko ovládateľné aj pre nováčikov.