Iný spôsob použitia systému Samba je jeho integrovanie do existujúcej siete Windows. Jednou z funkcií systému Samba je aj to, že môže slúžiť ako súborový a tlačový server pre používateľov AD.
Aj keď sa samba nedá použiť ako primárny radič domény v Active Directory - Active Directory Primary Domain Controller (PDC), Samba server môže byť nakonfigurovaná tak, aby sa tváril ako radič domény systému Windows NT4. Hlavná výhoda takejto konfigurácie je schopnosť centrálne spravovať prihlasovacie údaje všetkých používateľov a počítačov.
Existujú dve bezpečnostné úrovne dostupné pre sieťový protokol Common Internet Filesystem (CIFS): user-leve
Iné často používané použitie systému Samba je konfigurácia a zdieľanie tlačiarní v sieti lokálne nainštalovaných k serveru so systémom Ubuntu.
Pre úspešné prepojenie s klientami Windows Ubuntu zahrňuje poskytovanie a integrovanie služieb, ktoré sú spoločné s rozhraním Windows. Služby na zdieľanie dát a informácií o počítačoch a používateľoch pripojených do siete môžeme rozdeliť do troch hlavných kategórií podľa funkcionality:
Jeden z najčastejších spôsobov, ako spolu zapojiť počítače so systémami Ubuntu a Windows do jednej siete, je nastaviť systém Samba ako súborový server. Táto časť hovorí o spôsobe, akým sa Samba server nastaví tak, aby zdieľal súbory so stanicami so systémom Windows.